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為提升疑似病例的確診效率,華為云做了這件事

2020-02-18 08:46:59   作者:   來源:CTI論壇   評論:0  點擊:


  華為云聯(lián)合希望組正式發(fā)布病毒基因組實時分析平臺,該平臺覆蓋病毒樣本采集、病毒基因測序、數(shù)據(jù)傳輸、數(shù)據(jù)分析及展現(xiàn)全業(yè)務(wù)流程。(延伸閱讀:華為云推出新冠肺炎AI輔助診斷服務(wù),CT量化結(jié)果秒級輸出)

  與傳統(tǒng)方案相比,該平臺具有更便攜、檢測過程更快、更智能的優(yōu)勢,適合于在大范圍內(nèi)同時開展疫情的檢測工作,將極大提升疑似病例的確診效率,助力疫情防控。

  便攜

  單人可攜帶,隨時隨地進行基因采樣、測序

  新型冠狀病毒(2019-nCoV)感染的肺炎疫情暴發(fā)以來,傳統(tǒng)試劑盒(熒光定量PCR核酸檢測試劑盒)在患者臨床診斷和疑似患者排查中發(fā)揮了重要作用, 但是該方法對檢測環(huán)境有嚴格要求:

  • 需要對樣本集中送檢,實驗室檢測能力有限
  • 無法滿足當前快速增長的疑似患者的排查、診斷需求

  基于希望組的納米孔測序方案:

  使用小型化測序設(shè)備,單人即可攜帶,克服了場地限制,可以在各臨時醫(yī)療工作站、患者現(xiàn)場進行基因采樣和測序,為患者確診提供快速檢測手段,縮短患者等待時間、緩解檢測壓力,有效抑制疫情的進一步擴散。(延伸閱讀:希望組宣布完成基于納米孔測技術(shù)的冠狀病毒測序試劑盒的研發(fā))

  實時

  5G網(wǎng)絡(luò)實時上傳數(shù)據(jù),快速完成病毒分析

  在沒有固定IT基礎(chǔ)設(shè)施的臨時醫(yī)療站,或缺少有線網(wǎng)絡(luò)和本地計算資源的工作點,只能人工將采集的資源送遞到集中站點處理,時效性差。

  希望組與華為5G、華為云團隊一起完成了實時機動的測序數(shù)據(jù)上傳,并依托華為云基因容器的高性能:

  • 自動化測序分析引擎和海量的計算資源
  • 病毒數(shù)據(jù)的遠程上傳、分析,實現(xiàn)數(shù)據(jù)的實時采集、實時分析、實時上報

  該方案能夠無縫擴展到其他病原的檢測和監(jiān)測,符合傳染性病原疫情的早發(fā)現(xiàn),早隔離,迅速切斷傳播路徑的防控理念。
 

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  智能

  檢測病毒基因組變異,精準定位突變位點

  此外,對病毒基因組學(xué)和流行病學(xué)進行實時和快速研究也是疫情防控中最重要也是容易缺失的一環(huán)。

  例如:

  截止到2月13日,全國確診陽性患者達到59,000多例,但是全球所有新冠狀病毒的基因組數(shù)據(jù)卻只有87個,這對全球了解新冠狀病毒的產(chǎn)生,傳播(包括時間和空間溯源),演化以及病毒毒力和感染力的研究造成了巨大的困難。

  而這些研究對于檢測方案的研發(fā),相應(yīng)疫苗和藥物研發(fā)具有重大意義,并且能夠為疫情防控決策提供科學(xué)支持,其和診斷治療同樣重要甚至更為重要。

  希望組基于ONT第三代測序技術(shù)結(jié)合華為云基因容器+AI容器的實時病毒基因組檢測平臺能夠在數(shù)小時之內(nèi)同時完成樣本檢測以及病毒基因組變異檢測。

  突破了包括實時熒光RT-PCR和傳統(tǒng)第二代測序技術(shù)在內(nèi)的現(xiàn)有檢測技術(shù)的局限以及對場地、外界環(huán)境的限制、提升了流程檢測的便攜性和測序效率,并推進病毒檢測和基因組變異監(jiān)測工作全面下移,能夠更好地服務(wù)于新冠狀病毒的疫情防控,為廣大人民的健康保駕護航。

【免責聲明】本文僅代表作者本人觀點,與CTI論壇無關(guān)。CTI論壇對文中陳述、觀點判斷保持中立,不對所包含內(nèi)容的準確性、可靠性或完整性提供任何明示或暗示的保證。請讀者僅作參考,并請自行承擔全部責任。

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